手足口病是由肠道病毒引起的传染病，引发手足口病的肠道病毒有20多种，其中以柯萨奇病毒A16型和肠道病毒71型最为常见。通过对柯萨奇病毒A16型和肠道病毒71型及通用型核酸检测，直接反映人体内是否存在肠道病毒71型/通用型及柯萨奇病毒16型的感染，可作肠道病毒71型/柯萨奇病毒16型/通用型肠道病毒病毒感染的辅助诊断及其疗效监测的标准。